Kuna toiduainete tootmise või käsitlemisega seonduvatele ettevõtetele on kohustuslik toiduohutuse tagamiseks enesekontrollisüsteem (HACCP), rakendas Baltic Logistic Solutions esimese Eesti ettevõttena FSSC 22000 (Food Safety System Certification) rahvusvahelise sertifitseerimissüsteemi. See tähendab, et BLS vastab kõige uuematele toiduohutuse juhtimissüsteemide rahvusvahelistele standarditele.