Aktsionäride üldkoosolek kinnitas Eesti Raudtee 2006. aasta müügituluks veidi enam kui 1,8 miljardit krooni. Koos muude tuludega olid ettevõtte äritulud kokku 1,95 miljardit krooni. Eesti Raudteel on põhivara 3 098 832 000 krooni väärtuses ja omakapitali suurus 1 965 238 000 krooni.
Eesti Raudtee 2006. aastal kasum enne põhivara kulumit (EBITDA) oli 550 178 000 krooni. Ettevõtte puhaskasum oli 249 299 813 krooni, mis üldkoosoleku ettepanekul jäeti jaotamata ja suunati eelmiste perioodide jaotamata kasumisse.